环境微生物实验室建筑面积约为130平方米，配备显微镜、分光光度计、高速冷冻离心机、PCR仪、电泳系统、凝胶成像系统、高压蒸汽灭菌器等设备，服务于实验课程的教学活动。

环境微生物实验室，主要面向环境生态工程专业、资源循环科学与工程专业的学生开放，主要承担《环境微生物实验》等课程的实验教学任务，每学年服务学生为130人左右，利用率较高。

通过课程实验的教学，旨在培养培养学生对实际问题的观察、分析、判断和解决的能力以及一丝不苟、实事求是的科学态度和良好的工程素养。